主辦單位不同：省級計算機二級考試是由省教育廳主辦的考試;全國計算機二級考試由考試中心主辦。考試對象不同：省計算機僅僅允許省內在校生報考，已畢業的學生和社會人員不得報考;全國計算機則無任何門檻限制，均可以報考。

考試書不同：

省級計算機二級考試：在籍的非計算機專業學生，均可自愿向所在學校報名參加。考試成績合格者，由省教育廳委托高等學校計算機中心頒發統一的合格書，考試成績者，在合格書上注明“”字樣;

全國計算機二級考試：全國計算機合格書式樣按國際通行書式樣設計，用中、英兩種文字書寫，書編號全國統一，書上印有持有人身份號碼。該書全國通用，是持有人計算機應用能力的證明。